Министерство образования опубликовало рейтинг вузов страны за 2005 год, и, к сожалению, сибирские университеты и академии сдали свои позиции.
Три академии медицинская, геодезическая и водного транспорта, а также педагогический университет резко опустились вниз. Университет путей сообщения тоже «упал» с 19-го места в 2004 году на 41-е по итогам 2005 года. Улучшили показатели лишь архитектурная академия и университет телекоммуникаций и информатики (бывший институт связи). Остальные вузы остались примерно на тех же позициях, что и раньше. При определении рейтинга учитывались многие параметры, в том числе и качество преподавательского состава, количество студентов, наличие учащихся из других стран, объем научных исследований, обеспечение студентов общежитиями.