Выберите свой район: Новосибирск
Баган
Барабинск
Бердск
Болотное
Венгерово
Довольное
Здвинск
Искитим
Карасук
Черепаново
Каргат
Колывань
Кольцово
Коченево
Кочки
Краснозерское
Куйбышев
Купино
Кыштовка
Маслянино
Мошково
Новосибирск
Убинское
Обь
Ордынское
Северное
Сузун
Татарск
Тогучин
Усть-Тарка
Чаны
Чистоозерное
Чулым

Суперкомпьютер появился в распоряжении генетиков Академгородка

12.02.2021
Сергей Толмачев, ОТС
Новый сервер позволяет анализировать сочетание миллионов кусочков ДНК. Кадр из телесюжета "Новости ОТС"
Новый суперкомпьютер приобрели в центре коллективного пользования «Биоинформатика» в Новосибирске. Этим оборудованием будут пользоваться ученые из разных городов России. Оно позволяет просчитывать огромные массивы информации и создавать удобные приложения для телефонов.

В теплицах Института цитологии выращивают новые сорта зерновых специльно для сибирских условий. Чтобы получить результат, нужно скрещивать несколько поколений пшеницы и обязательно расшифровывать генетические коды растений. Это делают специальные приборы – секвенаторы. Но сам процесс протекает очень долго.

«Современные методы секвенирования могут читать очень маленькие фрагменты генома. Например, геном человека состоит из трех миллиардов пар оснований. А секвенаторы второго поколения, самые популярные, могут читать только примерно по 100 нуклеотидов, по 100 пар оснований», – сообщил старший научный сотрудник ФИЦ ИЦиГ СО РАН Михаил Генаев.

Новый сервер позволяет анализировать сочетание миллионов кусочков ДНК и складывать их, как огромный паззл. В суперкомпьютере 256 ядер. А объем информации, который он способен хранить, точно посчитать невозможно.

«Если взять всю напечатанную литературу, которая есть в мире, перевести ее в цифровой вид, – тогда сопоставимый порядок будет», – отметил начальник центра коллективного пользования «Биоинформатика» Института цитологии и генетики СО РАН Дмитрий Рассказов.

Геном пшеницы в шесть раз сложнее человеского. Но мало его расшифровать. Нужно еще связать мутации колоса с его внешними качествами – фенотипом. Если геном – это паспортные данные, то фенотип – фотография на паспорте растения. Сейчас его описывают вручную. Измеряют длину стебля, размеры.

Есть у селекционеров понятие «вес тысячи зерен» – таким методом считают будущую урожайность сорта. Использование нового сервера позволяет делать все это мгновенно. Ученые разработали даже приложение для смартфона.

«Если из колоса высыпать зерна на лист бумаги, сфотографировать его, то программа на мобильном телефоне посчитает количество зерен, для каждого зерна длину, ширину, площадь. Оценит его размер. Фактически это характеристики урожайности», – отметил ведущий научный сотрудник Курчатовского геномного центра ИЦиГ СО РАН Дмитрий Афонников.

Уже сейчас в очереди на использование суперкомпьютера – научные институты из разных городов, от Калининграда до Иркутска. Машине все равно, что просчитывать – ДНК пшеницы, геном мышей или нуклеотиды раковой опухоли. Работы для электронного мозга точно хватит.

Все выпуски новостей телеканала ОТС, а также программы «Итоги Недели», «ПАТРИОТ», «Экстренный вызов», «Пешком по Новосибирскойобласти», «ДПС– Дорога. Перекресток. Судьба», «От первого лица» выложены на сайте YouTube.

Вам было интересно?
Подпишитесь на наш канал в Яндекс. Дзен. Все самые интересные новости отобраны там.
Подписаться на Яндекс.Дзен
Похожие новости

В марте 2021 года, окинув невооруженным взглядом небесную сферу, можно увидеть лишь одну планету, но она настолько неприметная, что человек, не увлекающийся астрономией, не поймет, что это планета, а не звезда. Куда же исчезли все планеты?

Резонанс
Новости
Проект Большая Перемена
Тридцать лет назад широко известен стал телевизионный журналист, капитан милиции Владимир Чеплыгин. Сейчас Владимир Николаевич – ветеран милиции и подполковник МВД. Его книга «Капитан Чеплыгин рассказывает» вышла в 1993 году тиражом 100 тысяч экземпляров. Но в книге он рассказал далеко не все любопытное о криминальном Новосибирске давних лет. Продолжаем публиковать его воспоминания.

Во вторник, 2 марта, многие жители Искитима и Искитимского района в мессенджерах получали и делились со знакомыми аудио-сообщениями, в которых неизвестные предупреждали о новом виде мошенничества.
Со 2 марта временный порядок автопродления выплат ежемесячных денежных пособий на детей, введеный из-за пандемии, отменен. Теперь, как и раньше, для получения выплат необходимо написать заявление.



Подписка на газету Советская Сибирь на 2021 год