Товарооборот Новосибирской области с Киргизской Республикой в 2017 году составил 21 млн. долларов США (0,5% от внешнеторгового оборота Новосибирской области). Из Новосибирской области в Киргизию поставляются электрические машины и запчасти к ним, металлы (никель, алюминий, свинец) и изделия из них, химическая продукция, древесина, стекло, оптические и фотографические инструменты и аппараты, фармацевтическая продукция, продукты питания, товары народного потребления. Из Киргизии в Новосибирскую область поставляют овощи и фрукты.